Ministeeriumi üks põhiülesanne on töötada välja oma valitsemisala tegevusvaldkondades arengukavad ning korraldada nende rahastamine, elluviimine ja tulemuste hindamine.
Arengukavade koostamisel teeb ministeerium koostööd sotsiaalpartneritega ja valdkondlike huvigruppidega.
Huvilised saavad tutvuda ka vanemate strateegiliste dokumentidega.
Koostamisel olevad strateegilised dokumendid

Põllumajandus
- Põllumajanduse ja kalanduse valdkonna arengukava aastani 2030
- Eesti aiandussektori arengukava 2015–2020 (1.46 MB, PDF)
- Eesti lambakasvatussektori arengukava 2018–2023 (1.4 MB, PDF)
- Eesti lihaveisesektori visioonidokument 2016–2020 (370.79 KB, PDF)
- Eesti mahemajanduse tervikprogramm 2018–2021
- Eesti mahepõllumajanduse arengukava aastateks 2014–2020
- Eesti seemnemajanduse arengukava aastateks 2014–2020 (5.06 MB, PDF)
- Eesti teraviljasektori arengukava aastateks 2014–2020 (1.21 MB, DOCX)
- Põllumajandussektoris kliimamuutuste leevendamise ja kliimamuutustega kohanemise tegevuskava 2012–2020
- Taimekaitsevahendite säästva kasutamise tegevuskava aastateks 2019–2023
Kalandus
- Põllumajanduse ja kalanduse arengukava aastani 2030
- Euroopa Merendus-, Kalandus- ja Vesiviljelusfond (EMKVF) 2021–2027
- Euroopa Merendus- ja Kalandusfond (EMKF) 2014–2020
- Eesti vesiviljeluse mitmeaastane riiklik tegevuskava 2014–2020 (308 KB, DOC)
- Eesti vesiviljeluse sektori arengustrateegia 2014–2020 (1.29 MB, PDF)
Teadus ja arendus
- Mikroobide antibiootikumiresistentsuse vähendamise tegevuskava veterinaarmeditsiini valdkonnas aastateks 2019–2023 (1.46 MB, PDF)
- Põllumajanduslikud rakendusuuringud ja arendustegevus aastatel 2015–2021
- Põllumajanduskultuuride geneetilise ressursi kogumine, säilitamine ja kasutamine 2021–2027 (827.06 KB, PDF)
- Põllumajanduskultuuride geneetilise ressursi kogumine ja säilitamine aastatel 2014–2020
- Sordiaretusprogramm 2020–2030