В области управления Министерства находится два правительственных учреждения, три государственных учреждений, а также четыре юридических лица – два акционерное общество с участием государства и два целевое учреждение с участием государства. Компетенции учреждений при выполнении задач в области управления Министерства указаны в уставах учреждений.
-
Департамент сельскохозяйственных регистров и информации (PRIA)
PRIA осуществляет выплату государственных пособий, а также пособий Европейского союза на сельское хозяйство и развитие сельской жизни, пособий Европейского фонда рыболовства и пособий на управление рынком. Кроме того, PRIA ведет государственные регистры и другие базы данных, связанные с областью сельского хозяйства, а также обрабатывает и анализирует полученные данные.
-
Сельскохозяйственный и продовольственный департамент (PTA)
Сельскохозяйственный и продовольственный департамент осуществляет государственный надзор, а также определяет направления деятельности в области ветеринарии, гигиены корма, продовольственной безопасности, разведения сельскохозяйственных животных, управления рынком и органического сельского хозяйства. PTA осуществляет государственный надзор, а также определяет направления деятельности в области мелиорации земель, защиты растений, здоровья растений, охраны видов растений, семян и материала для вегетативного размножения, органического сельского хозяйства, обработки генетически модифицированных сельскохозяйственных культур, удобрений и продукции садоводства.
-
Ветеринарно-продовольственная лаборатория (VTL)
Ветеринарно-продовольственная лаборатория проводит лабораторные исследования с целью диагностирования болезней животных, делает анализы продуктов питания, корма и алкоголя с целью контроля безопасности и качества, а также выполняет задачи государственной референс-лаборатории и аккредитованной лаборатории
-
Центр сельскохозяйственных исследований (PMK)
Центр проводит государственные регистрационные и экономические испытания видов и сортов, испытания по надзору за партиями семян и лабораторные анализы семян; определяет содержание остатков пестицидов и загрязнителей в растительных и животных продуктах и почве; а также анализирует контрольные пробы, взятые из пестицидов, удобрений, кормов и продуктов питания.
-
Эстонский институт растениеводства (ETKI)
Институт занимается прикладными и основными исследованиями, делает метеорологические наблюдения и прогнозы, обеспечивает поддержание видов и сортов, а также сохранение и исследование генетических ресурсов, разводит новые виды и действует в качества центра семян, оказывает научное содействие системе поддержки, в целях обеспечения законодательства и государственного надзора.
-
Фонд развития сельских районов (MES)
Целью Фонда является поддержка экономического развития сельской местности Эстонии посредством применения целевых программ, поддерживающих предпринимательство.
-
Центр по контролю продуктивности (EPJ)
Центр занимается проведением контроля продуктивности сельскохозяйственных животных и оценкой их генетической ценности, а также независимым контролем качества молока.
-
Фонд "Эстонские музеи сельской жизни"
Музей находится в Тартуском уезде, на исторической мызе Юленурме, и знакомит посетителей с развитием сельского хозяйства и сельской жизни в Эстонии.
-
Vireen AS
AS Vireen занимается утилизацией отходов животноводства.